6、万州港
万州港地处长江中上游结合部，三峡库区腹心地带，素有“渝东门户”之称，重庆直辖后为渝东和三峡库区最大的港口。港口现有区域面积27.01平方公里，其中陆域0.44平方公里，水域26.57平方公里。万州港下辖忠县、西沱（含石宝寨）、云阳、奉节、巫山等五个县级港站。港口地理位置适中，是渝东、川东北、湘鄂、陕南、黔北等西南地区重要的物资出海通道，是长江十大港口之一，被国家列为长江干线重点建设的五大多用途港口之一。
5、寸滩港
寸滩港区地处长江上游，位于重庆市江北区寸滩镇，重庆朝天门下游约6公里的长江北岸。与重庆市内环高速公路、海尔一级公路及金渝大道相连，连接成渝、渝黔、渝遂、渝邻、渝宜等多条高速公路，紧邻渝怀铁路唐家沱铁路货运站，距重庆空港约10公里，背靠北部新区、高新技术产业开发区、经济技术开发区、港城工业园区和海尔工业园。目前,寸滩港区已建成集装箱泊位5个,去年集装箱吞吐量达到55万标箱,货源辐射到贵州、四川和陕西等地。
4、重庆果园港
果园港位于重庆市两江新区核心区域，是我国最大的内河水、铁、公联运枢纽港，采用的也是通常海港才有的直立式码头，占地共4平方公里，分为港前作业区和后港物流园区一期工程于2008年4月开工，2个散货泊位已于2010年12月建成并投入运行，形成吞吐能力200万吨。如今，果园港是国家发改委、交通部、市政府重点规划建设的第三代现代化内河港区，总投资超过100亿元，是长江上游航运中心建设的又一标志性工程，于2013年12月5日开港。
3、忠县新生港
新生港是忠县规划新建的大规模腹地吞吐港和区域水陆交汇枢纽，是忠县充分利用自身区位优势形成核心竞争力，特别是融入长江经济带，打造沿江立体交通走廊重要节点，服务国家“一带一路”战略的关键举措。新生港是常年深水良港，是三峡库区回水高水位全年都能到达的最西端，是支撑长江上游航运中心的重要交通节点，也是承接“疆煤入渝”铁水联运的重要口岸。新生港吞吐规模一期不低于1200万吨/年。
2、涪陵港
涪陵港有5000吨级泊位20个，年设计通过能力3000万吨，其中集装箱150万标箱、件杂货150万吨、散货2000万吨。2016年该区港口吞吐量共计完成2765.94万吨，同比增长10.33%。其中危化品完成360.09万吨，占总量的13.1%，集装箱完成3.6万标箱。从该区港口吞吐量完成情况分析，大宗货物主要为煤炭制品、金属矿石、矿建材料、化肥，共计完成1764万吨，占完成总量63.8%。
1、重庆港
重庆港（ChongqingPort），位于中国中西结合部，水路可直达长江八省二市，陆路与成渝、襄渝、渝黔、渝怀铁路和成渝、渝黔、重庆至武汉、重庆至长沙等高速公路相连，是长江上游最大的内河主枢纽港，现为全国内河主要港口。重庆港的经济腹地主要包括重庆市辖9区12县及四川、云南、贵州三省。重庆港系国家一类口岸，主要从事港口装卸、客货运输、水陆中转、仓储服务、物流配送、酒店旅游等多种综合性经营服务。2016年全区港口吞吐量共计完成2765.94万吨。
